Yüksek kararlılıkta Kibdelosporangium aridum rekombinant KaPETaz Kovalent immobilizasyonu ve yüksek hacimde üretimi


KERİMAK ÖNER M. N. (Yürütücü), BİNAY B., YILDIRIM D., ÇALOĞLU B.

Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje, BAP Araştırma Projesi, 2025 - Devam Ediyor

  • Proje Türü: Yükseköğretim Kurumları Destekli Proje
  • Destek Programı: BAP Araştırma Projesi
  • Başlama Tarihi: Kasım 2025
  • Bitiş Tarihi: Devam ediyor

Proje Özeti

Yaygın olarak kullanılan bir plastik olan polietilen tereftalat (PET) kalıcılığı nedeniyle önemli bir çevre kirleticisidir. Günümüzde var olan kimyasal yöntemler ile karşılaştırıldığında PET gideriminde enzimatik depolimerizasyon giderek daha güvenilir ve çevre dostu bir yöntem olarak kabul edilmektedir. Bu teknolojinin geliştirilmesi, biyolojik bozunmayı artırmak için yüksek kaliteli enzimlerin ve ilişkili biyoreaksiyon sistemlerinin mevcudiyetine bağlıdır. Ideonella sakaiensis'ten elde edilen PET'i parçalayan PETaz enzimi umut verici çözümler sunsa da yüksek sıcaklıklardaki sınırlı aktivitesi pratik uygulamalarını engellemektedir. Ayrıca, endüstriyel enzim preparatlarının üretim maliyeti öncelikle hedef enzimlerin ifade düzeyleri ve fermentasyon sonrası işleme maliyetleri tarafından belirlenmektedir. Bu sebeple, bu çalışmada bir önceki çalışmamızda katalitik üstünlüğünü Ideonella sakaiensis'ten elde edilen PETaz’a karşı kanıtlamış ve ifade düzeyi belirlenmiş olan Kibdelosporangium aridum rekombinant termostabil KaPETaz’ının yüksek hacimde üretilmesi amaçlanmıştır. Çalışma, rekombinant proteinlerin üretiminde sıklıkla kullanılan bir konakçı hücre olan Escherchia coli BL21 (DE3) hücresinde KaPETaz hidrolitik enzimi için yüksek verimli bir salgılama ekspresyon sistemi geliştirilerek maliyet etkin enzimatik PET geri dönüşümüne olan ihtiyaç göz önünde bulundurularak planlanmıştır. Sunulan çalışmanın bir diğer önemli amacı ise KaPETaz’ın var olan yüksek katalitik aktivitesinin endüstriyel kullanımlara uyarlanması amacıyla enzim mühendisliği uygulamalarından biri olan kovalent immobilizasyon yöntemiyle geliştirilmesidir. İmmobilize enzim formlarının geliştirilmesi, PET degradasyonunda enzimatik kataliz teknolojilerinin ekonomik ve endüstriyel uygulanabilirliğini artırmak, sürecin maliyetini düşürmek ve küresel çevresel etkisini hafifletmek açısından muazzam bir potansiyele sahiptir. Sunulan proje önerisinde, enzim immobilizasyonu için uygun bir destek materyali olarak kabul edilen, hem ucuz hem de yaygın bir prosesin yan ürünü olduğu için kolay ulaşılabilen bir materyal olması açısından silika tercih edilmiştir. Çalışmada, silika desteğinin üç farklı fonksiyonelleştirme yöntemi ile türevlendirilmesinin ardından yeni PETaz enziminin immobilizasyonu gerçekleştirilecektir. Son olarak bu çalışmada, literatüre yeni bir PET hidrolitik enziminin immobilize form/formlarının kazandırılmasının yanında proje çalışmasının gelecekteki çalışmalara katkı sağlaması da hedeflenirken yerli ve yeni PETaz enziminin yüksek hacimde üretiminin getireceği teknolojik yenilikle birlikte patent çalışmasının yapılıp endüstriyel uygulanabilirliğinin sağlanması amaçlanmaktadır.