TETRASİKLİN KONTROLÜ ALTINDA BAKTERİYAL HOK PROTEİNİ İLE İNDÜKLENEN MİTOFAJİNİN RFP-MİTO YARDIMI İLE TAKİBİ


Tezin Türü: Yüksek Lisans

Tezin Yürütüldüğü Kurum: Kocaeli Üniversitesi, Tıp Fakültesi, Temel Tıp Bilimleri, Türkiye

Tezin Onay Tarihi: 2023

Tezin Dili: Türkçe

Öğrenci: Hümeyra Şeyma Ünlü

Danışman: Murat Kasap

Özet:

Mitokondri, hücresel enerji homeostazını ve hücre ölümünü düzenleyen temel organeldir. Mitokondriyal ağ içerisinde hasarlanan mitokondrilerin, mitofaji adı verilen bir süreç ile temizlenmesi, hücrelerin sağlıklı olarak yaşamlarına devam edebilmeleri için büyük bir öneme sahiptir. Mitofajinin sadece mitokondriyal ağın sağlığını korumakla kalmayıp aynı zamanda bir bütün olarak hücre ve organizmanın sağlığını korumada da önemli rol oynadığı düşünülmektedir.

Mitofajinin bilinmeyen moleküler ayrıntıları ve mekanizmaları hücre modelleri kullanılarak açığa çıkarılmaya çalışılmaktadır. Ancak günümüzde kullanılan mitofaji modellerinde, mitofajiyi tetiklemek için mitokondrinin yanı sıra tüm hücresel sistemi etkileyebilen kimyasal ajanlar kullanılmaktadır. Kullanılan bu ajanların mitofajiyi tetiklerken oluşturduğu diğer hücresel yan etkiler daha doğal bir model olmadığı için göz ardı edilmektedir. Dolayısı ile hali hazırdaki hücresel mitofaji modelleri ile yapılan çalışmaların doğal süreçlere ait mitofajiyi modellemekte yetersiz kalmaktadır.

Bu amaçla bakterilerde konak hücre ölümünü, bakteri zarında por oluşturarak sağlayan, HOK proteini bir çeşit mitofajiyi tetiklemek için kullanılacaktır. Bu çalışmada mitokondriyi boyayan RFP proteini ile birlikte HOK proteinini bir MTS sinyal dizisi aracılığı ile mitokondri iç zarına yönlendirecek ve Hek293T hücrelerinde tetrasiklin (Tet) kontrollü altında ifadesi sağlanacaktır. İfade edilen RFP-HOK proteinlerinden HOK’un mitokondri iç zarında por oluşturarak zar potansiyelini bozması ve mitofajiyi tetiklemesi, RFP proteininin ise mitokondriyi kırmızıya boyayarak mitokondride meydana gelecek morfolojik değişimi floresan mikroskobi ile gözlenebilir hale getirmesi beklenmektedir.