Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Doktora
Tezin Yürütüldüğü Kurum: Kocaeli Üniversitesi, Teknoloji Fakültesi, Biyomedikal Mühendisliği, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2019
Tezin Dili: İngilizce
Öğrenci: Abula Ayemugu
Danışman: Murat Kasap
Özet:
Parkin 52 kDa'luk E3 ubikitin ligaz aktivitesi gösteren bir proteindir. Parkin ubikitin-proteozom sisteminde rol alarak hücre içi artık ve ömrünü tamamlamış proteinlerin temizlenmesinde rol almaktadır. Parkin üzerinde meydana gelen bazı mutasyonlar erken yaşta ortaya çıkan Parkinson Hastalığına sebep olmaktadır. Bu nedenle Parkin bilim adamlarının dikkatini çekmiş, bu protein ile sayısız çalışma yapılmış ve bu proteinin Parkinson hastalığındaki önemine dair önemli bilgiler elde edilmiştir. Son yıllarda yapılan çalışmalar Parkin'nin bilinen rolünün yanı sıra kanserle olan ilişkisini de ortaya çıkarmış ve Parkin'i kanser çalışmalarının merkezine oturtmuştur. Parkin bir çok kanser türünde delesyona uğradığı için tumor süpresör gen kategorisinde değerlendirilmeye alınmıştır. Hatta yapılan bazı çalışmalarda Parkin'in tumor supresör görevini nasıl yerine getirdiğine dair ipuçları elde edilmiş ve Parkin'nin hücre döngüsünde rol alan bazı proteinleri doğrudan etkilediği gösterilmiştir. Ancak tüm bu çalışmalar Parkin ve kanser arasındaki ilişkiyi detayları ile ortaya koyacak nitelikte değildir. Bu nedenle bu tez kapsamında Parkin ve kanser arasındaki ilişkiyi daha detaylı inceleyebilmek için Parkin ifade eden SH-SY5Y hücrelerinden nüklear proteinleri zenginleştirerek karşılaştırmalı çekirdek proteomu ve çekirdek fosfoproteomu analizleri yaptık. Elde ettiğimiz sonuçlar bize bu güne kadar Parkin'le doğrudan veya dolaylı olarak etkileştiği bilinmeyen proteinlerin varlığını ortaya çıkardı. Tanımlanan bu proteinler ile yaptığımız biyoinformatik analizler sonucunda Parkin'nin tumor süpresör aktivitesini DNA tamir mekanizmalarına verdiği destek üzerinden yapabileceğini gösterdik. Bu tez çalışması Parkinson hastalığı ile kanser arasındaki köprünün kurulması için atılmış bir adım olup elde edilen veriler bu ilişkinin detayları hakkında bizlere ışık tutmaktadır.