Akademik Veri Yönetim Sistemi
Tezin Türü: Yüksek Lisans
Tezin Yürütüldüğü Kurum: İstanbul Üniversitesi-Cerrahpaşa, Lisansüstü Eğitim Enstitüsü, Biyofizik Anabilim Dalı Başkanlığı, Türkiye
Tezin Onay Tarihi: 2025
Tezin Dili: Türkçe
Öğrenci: SİNEM SİPAHİOĞLU KARA
Asıl Danışman (Eş Danışmanlı Tezler İçin): Handan Tuncel
Eş Danışman: Elif Kaçar
Özet:
Meknanobiyoloji,
hücrelerin fiziksel özelliklerini ve hücrenin uygulanan kuvvetlere nasıl tepki
verdiğini araştıran gelişmekte olan bir araştırma alanıdır. Hücre karar almak
için hücre dışı çevre tarafından iletilen mekanik bilgileri algılar ve işler.
Hücrelerin mekanobiyolojik yönlerini araştırmak için kullanılan güncel
yöntemlerden biri de Optik Tuzaklama (OT) sistemlerinin kullanımıdır. OT cihazı
kullanılarak mikron mertebesindeki parçacıkların tuzaklanması ve manipüle
edilmesi mümkündür. Tuzaklama ve manipülasyon süreçleri, yüksek sayısal
açıklığa (NA) sahip olan bir objektif kullanılarak oluşturulan odaklanmış lazer
ışını etkisiyle meydana gelen kuvvetlerin sonucu olarak oluşur. Optik cımbız
sisteminin kullanıldığı bu yöntem, invaziv olmaması, yüksek hassasiyetle
kontrol edilebilir olması nedeniyle, mekanobiyolojik yaklaşımlarda kullanmak
için güçlü bir yöntemdir. Ayrıca OT’ler sadece mekanobiyoloji alanında değil
Fizik, Biyofizik, Biyoteknoloji, Malzeme Bilimi gibi alanlarda da
kullanılmaktadır.
Bu
tez çalışmasında mekanobiyolojik olarak incelenen canlı yapı olarak, tüm genom
dizilimi bilinen ve temin edilmesi kolay olan Saccharomyces cerevisiae (S.cerevisiae)
kullanılmıştır. S.cerevisiae ile ilgili geniş bir bilgi birikimine sahip
olunmasına rağmen mekanik özellikleri ile ilgili bilinenler azdır. Çalışma
kapsamında, OT sistemi kullanarak S. cerevisiae’in tuzaklanmasının
gerçekleştirilmesi için temel parametreler teorik olarak hesaplanmıştır. Ayrıca
deneysel olarak da OT ölçüm tekniği kullanılarak S. cerevisiae
tuzaklanması gözlemlenmiştir. Bu çalışma ile mekanobiyoloji alanında yapılan
çalışmalara bir bakış açısı sunmak ve gelecekte bu alanda gerçekleşecek olan
çalışmalara öncül bilgilerin sağlanması amaçlanmıştır.