Hızlı protein sıvı kromatografisi (FPLC) protein ve peptit karışımlarını analiz etmek veya saflaştırmak için kullanılan bir sıvı kromatografi şeklidir. Peptitleri esas olarak boyut ve yüke göre ayırmak için kullanılan orta basınçlı bir kromatografidir.
FPLC, cihaza bağlı kolon bazlı bir ayırma sağlar. FPLC ile kullanılan kolonlar, makromolekülleri boyuta (boyut dışlama kromatografisi, SEC), yük dağılımına (iyon etkileşimi, IEX), hidrofobik etkileşme (HI) veya afiniteye göre ayırabilir. Uygun bir kolon seçimi ile örneklerin tuzsuzlaştırılması sağlanabilir.