Akademik Veri Yönetim Sistemi
Epigenetik, Yelda Tarkan Ergügen, Editör, Türkiye Klinikleri Yayınevi, Ankara, ss.1-137, 2023
Epigenetik alanında kullanılan teknikler metilasyon ve histon modifikasyonlarını belirlemeye
dayalı yöntemler olarak iki ana başlık altında tartışılmaktadır. Nükleotit seviyesindeki DNA metilasyonu,
temel epigenetik mekanizmaların başında gelmektedir. DNA metilasyonunu saptamak için PCR
ve diğer ileri moleküler teknikler doğrudan kullanılamazlar. DNA üzerinde metilasyona dönük bir araştırma
yapılmak isteniyorsa çalışma materyalinde bazı ön işlemlerin uygulanması gerekmektedir. DNA
ön işlemesinde kullanılan teknikler üç başlıkta sınıflandırılabilir: 1. Restriksiyon enzimi kesimine dayalı
teknikler, 2. Bisülfit modifikasyonuna dayalı teknikler, 3. Afinite arttırma temeline dayalı teknikler. Metilasyon
dışında epigenetik düzenleyici mekanizmalardan bir tanesi de histon modifikasyonlarıdır. Histon
proteinleri üzerindeki kovalent modifikasyonlar, DNA replikasyonu, kromozomal ayrılma, onarım
ve gen ekspresyonu gibi hücre fonksiyonlarında temel düzenleyici rollere sahiptirler. Histon modifikasyonunu
belirlemek için kromatin immün-presipitasyon deneyi ve buna bağlı yaklaşımlar öne çıkmaktadır.
Bu çalışma kapsamında epigenetik araştırma yöntemleri ve veri analizi yaklaşımları ayrıntılarıyla
anlatılmaktadır.